GraphQL thường bị nhầm lẫn với công nghệ cơ sở dữ liệu. Đây là một quan niệm sai lầm, GraphQL là ngôn ngữ truy vấn cho API - không phải cơ sở dữ liệu . Theo nghĩa đó, nó là cơ sở dữ liệu bất khả tri và có thể được sử dụng với bất kỳ loại cơ sở dữ liệu nào hoặc thậm chí không có cơ sở dữ liệu nào cả.